レトリバ、最新の核酸医薬品向け検索システムを発表！2026年版の魅力とは

株式会社レトリバが提供開始した「GGGenome パッケージ版 2026年版」

東京・豊島区を拠点にする株式会社レトリバは、創薬に革新をもたらす高速塩基配列検索システム「GGGenome パッケージ版 2026年版」の提供を始めました。このシステムは、核酸医薬品に特化したもので、特にオフターゲット評価における研究の効率化に寄与することを目的としています。特に近年、siRNAやASOといった核酸医薬品の研究が盛んになる中で、安全性評価やオフターゲット作用の精密な評価が一層、重要になっています。

「GGGenome」の概要と特徴

「GGGenome」は、特に短鎖塩基配列の高速検索を実現するシステムであり、従来の汎用的な検索ツールが抱えていたミスマッチやギャップによる検索漏れを克服しています。このシステムは、国立遺伝学研究所によって提供されるウェブ版（https://gggenome.dbcls.jp）とも連携しつつ、オフライン環境でも利用可能なパッケージ版として提供されています。

この2026年版の主なアップデートには、最新のデータベース「RefSeq release 230」と「D3G 26.03」への対応が含まれています。これにはヒトを含む9種類の生物が対象となり、創薬において核心的な役割を果たします。

高速化された検索機能

新しく実装された「GGGenome パッケージ版」では、検索処理のスピードと効率が大幅に向上しました。特に、検索時の結果件数の上限や、DBのメモリ常駐機能の導入が注目されています。これにより、最大で1000万件の結果を抽出できるようになり、負荷の大きい大規模な検索でも快適に行うことができます。さらに、一括検索が可能な「Bioret tool」が導入され、複数のクエリを一度に処理できる仕様も追加されています。

注目遺伝子の抽出機能

このシステムの魅力の一つは、特定の遺伝子を検索結果内でハイライト表示できる点です。これにより、大量のデータからオフターゲット候補を迅速に抽出し、リスクの高い遺伝子を効率的に特定することができます。

オリジナル検索UIとその展望

さらに、2026年版ではオリジナル検索UI（ベータ版）が導入され、転写産物のメタ情報に基づいた検索結果の抽出が可能になりました。これにより、研究者はより目的に合った進化した検索体験を享受できるでしょう。

今後の課題と展望

今後もレトリバは、核酸医薬品の設計やオフターゲット評価をさらに進化させ、創薬研究の効率化を目指していく銘があるとのことです。

そのため、今後も「GGGenome パッケージ版」のさらなる機能強化や新データベースの追加に期待がかかります。株式会社レトリバは、「AI技術で、人を支援する。」という理念のもと、自然言語処理や機械学習を用いた革新的なソリューションを提供しています。